Возможно при выключении завершение работы происходит по каким то причинам некорректно и компьютер автоматически откатывает систему до последней рабочей точки восстановления, естественно убрав то что было изменено с того момента когда это точка записывалась.
Это конечно если исключить возможность того что это результаты деятельности какого либо вируса.
Еще есть программы (например ShadowUser)которые специально предназначены для того чтобы для того чтобы откатывать все изменения и удаляя новые созданные файлы в том числе на исходное состояние.Предназначены эти программы для того чтобы предотвращать нежелательные изменения в системе чтобы неграмотный пользователь чего лишнего та не понаделал. Хоть вы и говорите что пользуетесь компьютером только один, но может быть случайно что-то непонятное поставили. Проверьте на счет неизвестных вам программ, из под администратора естественно.
Лучше было бы конечно чтобы вы показали компьютер вживую какому либо специалисту, заочно с такими вещами сложно разобраться.
 | 
Древовидный вид