Чем занимается плагин System?
 

При установке JomSocial этот плагин не ставил, а сейчас нашел его в папке стандартных плагинов. В описании: Core Plugin. Но я уже понял, что лучшее враг хорошего. Без этого плагина все вроде работает. Тот же вопрос касается плагина Input. В их внутренности пока не залезал, надеюсь найдутся знатоки.